MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 42053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017270	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423363
2	NC_017270	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423363
3	NC_017270	CAG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423363
4	NC_017270	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423363
5	NC_017270	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423363
6	NC_017270	GGT	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423363
7	NC_017270	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423363
8	NC_017270	ATG	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423364
9	NC_017270	A	6	6	839	844	100 %	0 %	0 %	0 %	384423364
10	NC_017270	ATC	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423364
11	NC_017270	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423364
12	NC_017270	GCTC	2	8	985	992	0 %	25 %	25 %	50 %	384423364
13	NC_017270	CGG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423364
14	NC_017270	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423364
15	NC_017270	CAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423364
16	NC_017270	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423364
17	NC_017270	GC	3	6	1315	1320	0 %	0 %	50 %	50 %	384423364
18	NC_017270	T	6	6	1331	1336	0 %	100 %	0 %	0 %	384423364
19	NC_017270	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423364
20	NC_017270	GGT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423364
21	NC_017270	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423364
22	NC_017270	TTGG	2	8	1554	1561	0 %	50 %	50 %	0 %	384423364
23	NC_017270	ATG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423364
24	NC_017270	TCT	3	9	1642	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423364
25	NC_017270	CCA	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423364
26	NC_017270	ATCA	2	8	1779	1786	50 %	25 %	0 %	25 %	384423364
27	NC_017270	CGG	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423364
28	NC_017270	GAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423364
29	NC_017270	ATGA	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	384423364
30	NC_017270	GCT	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423364
31	NC_017270	GCGT	2	8	2060	2067	0 %	25 %	50 %	25 %	384423364
32	NC_017270	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423364
33	NC_017270	ACTT	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	384423365
34	NC_017270	T	6	6	2289	2294	0 %	100 %	0 %	0 %	384423365
35	NC_017270	ACCA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	0 %	50 %	384423365
36	NC_017270	GAA	3	9	2385	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423365
37	NC_017270	TCT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
38	NC_017270	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
39	NC_017270	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423365
40	NC_017270	GTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423365
41	NC_017270	CCAA	2	8	2541	2548	50 %	0 %	0 %	50 %	384423365
42	NC_017270	CTTTCT	2	12	2654	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
43	NC_017270	CAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
44	NC_017270	ATC	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
45	NC_017270	GCA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423365
46	NC_017270	CAC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
47	NC_017270	GAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423365
48	NC_017270	CAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423365
49	NC_017270	CAGTG	2	10	2878	2887	20 %	20 %	40 %	20 %	384423365
50	NC_017270	CAAC	2	8	2904	2911	50 %	0 %	0 %	50 %	384423365
51	NC_017270	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
52	NC_017270	TTTG	2	8	3024	3031	0 %	75 %	25 %	0 %	384423365
53	NC_017270	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423365
54	NC_017270	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
55	NC_017270	AGT	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423365
56	NC_017270	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
57	NC_017270	GTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423365
58	NC_017270	CTT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
59	NC_017270	CAC	3	9	3239	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
60	NC_017270	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
61	NC_017270	CAG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423365
62	NC_017270	CATA	2	8	3305	3312	50 %	25 %	0 %	25 %	384423365
63	NC_017270	ATT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423365
64	NC_017270	CACT	2	8	3479	3486	25 %	25 %	0 %	50 %	384423365
65	NC_017270	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423365
66	NC_017270	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423365
67	NC_017270	CGC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423365
68	NC_017270	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423365
69	NC_017270	AGGAGC	2	12	3759	3770	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384423365
70	NC_017270	CTG	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423365
71	NC_017270	TTC	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
72	NC_017270	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423365
73	NC_017270	GAAA	2	8	3846	3853	75 %	0 %	25 %	0 %	384423365
74	NC_017270	GA	3	6	4140	4145	50 %	0 %	50 %	0 %	384423366
75	NC_017270	CAAG	2	8	4164	4171	50 %	0 %	25 %	25 %	384423366
76	NC_017270	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423366
77	NC_017270	GC	3	6	4200	4205	0 %	0 %	50 %	50 %	384423366
78	NC_017270	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423366
79	NC_017270	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423366
80	NC_017270	GCGA	2	8	4366	4373	25 %	0 %	50 %	25 %	384423366
81	NC_017270	GAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423366
82	NC_017270	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423367
83	NC_017270	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423367
84	NC_017270	ATG	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423367
85	NC_017270	TTGA	2	8	4886	4893	25 %	50 %	25 %	0 %	384423368
86	NC_017270	CTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423368
87	NC_017270	ACC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423368
88	NC_017270	T	6	6	5057	5062	0 %	100 %	0 %	0 %	384423368
89	NC_017270	CACC	2	8	5080	5087	25 %	0 %	0 %	75 %	384423368
90	NC_017270	CAG	3	9	5123	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423368
91	NC_017270	CG	3	6	5150	5155	0 %	0 %	50 %	50 %	384423368
92	NC_017270	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423368
93	NC_017270	GCC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423368
94	NC_017270	AG	3	6	5186	5191	50 %	0 %	50 %	0 %	384423368
95	NC_017270	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423368
96	NC_017270	ATC	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423368
97	NC_017270	T	6	6	5270	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	384423368
98	NC_017270	CG	3	6	5316	5321	0 %	0 %	50 %	50 %	384423368
99	NC_017270	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423368
100	NC_017270	CGCAG	2	10	5470	5479	20 %	0 %	40 %	40 %	384423368
101	NC_017270	GAT	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423368
102	NC_017270	TC	3	6	5524	5529	0 %	50 %	0 %	50 %	384423368
103	NC_017270	ATC	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423368
104	NC_017270	TCTGC	2	10	5631	5640	0 %	40 %	20 %	40 %	384423369
105	NC_017270	ACC	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423369
106	NC_017270	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423369
107	NC_017270	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	384423369
108	NC_017270	GAGG	2	8	5782	5789	25 %	0 %	75 %	0 %	384423369
109	NC_017270	TTGAT	2	10	5790	5799	20 %	60 %	20 %	0 %	384423369
110	NC_017270	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423369
111	NC_017270	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423369
112	NC_017270	CAAC	2	8	6018	6025	50 %	0 %	0 %	50 %	384423369
113	NC_017270	GTA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423369
114	NC_017270	AGC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423369
115	NC_017270	A	6	6	6092	6097	100 %	0 %	0 %	0 %	384423369
116	NC_017270	GCA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423369
117	NC_017270	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423370
118	NC_017270	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423370
119	NC_017270	CAGA	2	8	6560	6567	50 %	0 %	25 %	25 %	384423370
120	NC_017270	ATCA	2	8	6777	6784	50 %	25 %	0 %	25 %	384423370
121	NC_017270	CAAA	2	8	6878	6885	75 %	0 %	0 %	25 %	384423370
122	NC_017270	CA	3	6	6946	6951	50 %	0 %	0 %	50 %	384423370
123	NC_017270	AGA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423370
124	NC_017270	TG	3	6	7264	7269	0 %	50 %	50 %	0 %	384423371
125	NC_017270	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423371
126	NC_017270	CGA	2	6	7328	7333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423371
127	NC_017270	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
128	NC_017270	ATG	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423372
129	NC_017270	GCC	2	6	7650	7655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423372
130	NC_017270	TCG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
131	NC_017270	GAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423372
132	NC_017270	TGC	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
133	NC_017270	CAA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
134	NC_017270	GCG	2	6	7898	7903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423372
135	NC_017270	GGC	2	6	7925	7930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423372
136	NC_017270	TGC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
137	NC_017270	TTG	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423372
138	NC_017270	AAC	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
139	NC_017270	GTG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423372
140	NC_017270	AAC	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
141	NC_017270	GAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423372
142	NC_017270	CTA	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423372
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145	NC_017270	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423372
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149	NC_017270	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423372
150	NC_017270	AGA	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423372
151	NC_017270	GCC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423372
152	NC_017270	TGA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423372
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154	NC_017270	CTTT	2	8	8376	8383	0 %	75 %	0 %	25 %	384423372
155	NC_017270	CGTG	2	8	8407	8414	0 %	25 %	50 %	25 %	384423372
156	NC_017270	GC	3	6	8424	8429	0 %	0 %	50 %	50 %	384423372
157	NC_017270	GCCAAC	2	12	8444	8455	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384423372
158	NC_017270	GATT	2	8	8476	8483	25 %	50 %	25 %	0 %	384423372
159	NC_017270	CGTG	2	8	8485	8492	0 %	25 %	50 %	25 %	384423372
160	NC_017270	TTA	2	6	8507	8512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423372
161	NC_017270	TAC	2	6	8567	8572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423372
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164	NC_017270	GGC	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423372
165	NC_017270	AG	3	6	8758	8763	50 %	0 %	50 %	0 %	384423372
166	NC_017270	AGA	2	6	8776	8781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423372
167	NC_017270	GCAG	2	8	9065	9072	25 %	0 %	50 %	25 %	384423373
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171	NC_017270	CCAA	2	8	9312	9319	50 %	0 %	0 %	50 %	384423373
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179	NC_017270	GTG	2	6	9708	9713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423373
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251	NC_017270	GC	4	8	16782	16789	0 %	0 %	50 %	50 %	384423379
252	NC_017270	GCCA	2	8	16792	16799	25 %	0 %	25 %	50 %	384423379
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254	NC_017270	TCT	2	6	16895	16900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423379
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256	NC_017270	TTC	2	6	16921	16926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423379
257	NC_017270	TTG	2	6	16970	16975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423379
258	NC_017270	CTT	2	6	16995	17000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423379
259	NC_017270	TTGG	2	8	17054	17061	0 %	50 %	50 %	0 %	384423379
260	NC_017270	GAT	2	6	17083	17088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423379
261	NC_017270	TTTGGC	2	12	17197	17208	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384423379
262	NC_017270	CCA	2	6	17217	17222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423379
263	NC_017270	ACG	2	6	17275	17280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423379
264	NC_017270	CGA	2	6	17331	17336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423379
265	NC_017270	GCA	2	6	17366	17371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423379
266	NC_017270	TCA	2	6	17393	17398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423379
267	NC_017270	CTT	2	6	17442	17447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423379
268	NC_017270	GC	3	6	17552	17557	0 %	0 %	50 %	50 %	384423379
269	NC_017270	TCTGC	2	10	17583	17592	0 %	40 %	20 %	40 %	384423379
270	NC_017270	CGGT	2	8	17618	17625	0 %	25 %	50 %	25 %	384423379
271	NC_017270	CCA	2	6	17688	17693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423379
272	NC_017270	AGA	2	6	17718	17723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423379
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274	NC_017270	GCA	2	6	17823	17828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423379
275	NC_017270	T	6	6	17830	17835	0 %	100 %	0 %	0 %	384423379
276	NC_017270	CTG	2	6	17895	17900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423379
277	NC_017270	TTC	2	6	17917	17922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423379
278	NC_017270	TCA	2	6	17934	17939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423379
279	NC_017270	CCA	2	6	17952	17957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423379
280	NC_017270	CTT	2	6	17967	17972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423379
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283	NC_017270	TTG	2	6	18022	18027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423379
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286	NC_017270	GCC	2	6	18311	18316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423379
287	NC_017270	TTG	2	6	18340	18345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423379
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290	NC_017270	TTGG	2	8	18452	18459	0 %	50 %	50 %	0 %	384423379
291	NC_017270	ACG	2	6	18509	18514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423379
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295	NC_017270	TTCTG	2	10	18733	18742	0 %	60 %	20 %	20 %	384423380
296	NC_017270	CTT	2	6	18744	18749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423380
297	NC_017270	TAA	2	6	18784	18789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423380
298	NC_017270	AAGT	2	8	18979	18986	50 %	25 %	25 %	0 %	384423380
299	NC_017270	TGG	2	6	19045	19050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423380
300	NC_017270	CCAGA	2	10	19092	19101	40 %	0 %	20 %	40 %	384423380
301	NC_017270	AAGT	2	8	19204	19211	50 %	25 %	25 %	0 %	384423380
302	NC_017270	CA	3	6	19314	19319	50 %	0 %	0 %	50 %	384423380
303	NC_017270	TGT	2	6	19367	19372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423380
304	NC_017270	TGA	2	6	19385	19390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423380
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341	NC_017270	CG	3	6	22199	22204	0 %	0 %	50 %	50 %	384423385
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374	NC_017270	ACCG	2	8	24019	24026	25 %	0 %	25 %	50 %	384423386
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380	NC_017270	GTG	2	6	24245	24250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423386
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382	NC_017270	TGT	2	6	24378	24383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423386
383	NC_017270	CTGG	2	8	24411	24418	0 %	25 %	50 %	25 %	384423386
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